Được thai nghén ngay từ những năm đầu thập kỷ 90 của Thế kỷ trước, trải qua nhiều giai đoạn vận động, thành lập, đến ngày 07/01/2009, Bộ trưởng Bộ Nội vụ đã ký Quyết định số 12 /QĐ-BNV thành lập Hội Thầy thuốc trẻ Việt Nam. Hội Thầy thuốc trẻ Việt nam là một thành viên tập thể của Hội Liên hiệp Thanh niên Việt Nam. Hội là một tổ chức xã hội nghề nghiệp tự nguyện của các Thầy thuốc trẻ không phân biệt thành phần chính trị, xã hội, dân tộc, tôn giáo; cùng phấn đấu vì sự phát triển của lực lượng thầy thuốc trẻ và sự nghiệp chăm sóc và bảo vệ sức khoẻ nhân dân. Có thể nói việc ra đời Hội Thầy thuốc trẻ Việt Nam là sự kiện minh chứng cho sự quyết tâm đặt mình vào vị trí mới của những người trẻ đang công tác trong lĩnh vực bảo vệ, chăm sóc và nâng cao sức khỏe nhân dân. Quyết tâm của lực lượng thầy thuốc trẻ muốn phát huy sức trẻ, tình thần xung kích, tình nguyện và muốn được cống hiến hết sức mình cho cộng đồng, cho xã hội.

Tháng 1/2015, Hội Thầy thuốc trẻ Việt Nam đã tiến hành Đại hội Đại biểu toàn quốc lần thứ III tại Hà Nội để đánh giá kết quả hoạt động của Hội Thầy thuốc trẻ Việt Nam khóa II, thông qua các văn kiện, xác định phương hướng công tác Hội nhiệm kỳ III (2015 – 2020). Với vai trò là đại diện cho lực lượng thầy thuốc trẻ Việt Nam là hội viên của Hội trong việc bảo vệ quyền, lợi ích chính đáng và hợp pháp của hội viên trước pháp luật và công luận, bồi dưỡng, hỗ trợ lực lượng thầy thuốc trẻ nâng cao trình độ nhận thức, chuyên môn, nghiệp vụ trong học tập, nghiên cứu khoa học và trong công tác; Hội Thầy thuốc trẻ Việt Nam đã xác định những chức năng, nhiệm vụ trọng tâm đó là: Phát động các chương trình, cuộc vận động của Hội; tổ chức các hoạt động tình nguyện, xung kích của đội ngũ các thầy thuốc trẻ Việt Nam trong công tác bảo vệ, chăm sóc và nâng cao sức khỏe nhân dân đặc biệt là đồng bào nghèo, sống tại vùng sâu, vùng xa và các vùng đặc biệt khó khăn; tổ chức các cuộc hội thảo, diễn đàn nhằm cung cấp, trao đổi thông tin, kiến thức, đề tài khoa học giữa các thầy thuốc trẻ,  giữa thầy thuốc trẻ với các cơ quan Đảng, Nhà nước và các tổ chức xã hội; Tập hợp thầy thuốc trẻ trong việc triển khai các nghiên cứu y tế công cộng nhằm góp phần cùng ngành Y tế đẩy mạnh công tác bảo vệ, chăm sóc và nâng cao sức khỏe nhân dân. Bồi dưỡng nâng cao trình độ chuyên môn và nghiệp vụ quản lý cho hội viên thông qua các diễn đàn trao đổi kinh nghiệm và nâng cao kiến thức, các lớp tập huấn ngắn hạn và các chương trình tham quan trao đổi kinh nghiệm trong nước và quốc tế…

Thông qua các hoạt động nhằm nâng cao y đức, y nghiệp trong đội ngũ thầy thuốc trẻ; nâng cao nhận thức về giá trị nghề nghiệp, tăng cường nhận thức về y nghiệp cho các thầy thuốc trẻ ở các cấp thông qua các hoạt động tuyên tryền vận động như: tổ chức hội nghị, hội thảo, tọa đàm, xây dựng diễn đàn (forum), và tổ chức cuộc thi tìm hiểu về y nghiệp. Thường xuyên tổ chức các lớp tập huấn bồi dưỡng kỹ năng giao tiếp, ứng xử, đón tiếp, chăm sóc người bệnh cho Thầy thuốc trẻ. Đồng thời, tham gia phản biện, đề xuất với Bộ Y tế những chính sách liên quan đến chính sách, chế độ đãi ngộ đối với đội ngũ cán bộ y tế, đặc biệt là các thầy thuốc trẻ mới ra trường.

Trong vấn đề nâng cao kiến thức chuyên môn và nghiên cứu khoa học, Hội đã thường xuyên tổ chức các lớp tập huấn về cơ bản nghiên cứu khoa học cho lực lượng Thầy thuốc trẻ, đặc biệt Thầy thuốc trẻ tuyến cơ sở. Đồng thời tổ chức Hội nghị khoa học, Hội thảo, giao lưu về các đề tài nghiên cứu khoa học trong các bệnh viện lớn, trường Đại học Y, Dược để tuyên truyền, giới thiệu trong lực lượng Thầy thuốc trẻ.

Thường xuyên tổ chức các khóa đào tạo ngắn hạn, đào tạo lại, đào tạo liên tục cho thầy thuốc trẻ tuyến y tế cơ sở cả về quản lý và chuyên môn; Xây dựng cơ sở dữ liệu trực tuyến nhằm cung cấp và chia sẻ tài liệu, công trình khoa học, cẩm nang, giáo trình đào tạo, trong đội ngũ các thầy thuốc.

Trong công tác đảm bảo an sinh xã hội và vì sức khỏe cộng đồng. Hội đã phát huy tính xung kích, tình nguyện của thầy thuốc trẻ trong việc thực hiện nghĩa vụ xã hội của người thầy thuốc khi quy định này được Bộ Y tế ban hành; Tiếp tục đẩy mạnh công tác khám bệnh, tư vấn sức khỏe và cấp phát thuốc miễn phí cho các gia đình chính sách, gia đình có công với cách mạng, trẻ em nghèo, các vùng bị thiên tai, lũ lụt. Cùng với đó là việc vận động các nguồn lực xã hội, các tổ chức tài chính, các quỹ từ thiện, các tổ chức trong và ngoài nước để tạo các điều kiện đảm bảo cho các hoạt động tình nguyện và các chương trình y tế công cộng của Hội....